MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84c

Total Repeats: 6796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011987	CGC	2	6	143289	143294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102102
2502	NC_011987	CG	3	6	143303	143308	0 %	0 %	50 %	50 %	222102102
2503	NC_011987	GCG	2	6	143320	143325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102102
2504	NC_011987	CCG	2	6	143357	143362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102102
2505	NC_011987	GCCA	2	8	143374	143381	25 %	0 %	25 %	50 %	222102102
2506	NC_011987	TTC	2	6	143425	143430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102102
2507	NC_011987	ATC	2	6	143458	143463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102102
2508	NC_011987	CGC	2	6	143466	143471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102102
2509	NC_011987	TGA	2	6	143604	143609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102102
2510	NC_011987	CGT	2	6	143631	143636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102102
2511	NC_011987	TCTCG	2	10	143718	143727	0 %	40 %	20 %	40 %	222102102
2512	NC_011987	CGCAT	2	10	143740	143749	20 %	20 %	20 %	40 %	222102102
2513	NC_011987	GGGC	2	8	143760	143767	0 %	0 %	75 %	25 %	222102102
2514	NC_011987	CTCTT	2	10	143891	143900	0 %	60 %	0 %	40 %	222102102
2515	NC_011987	ATA	2	6	143981	143986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102102
2516	NC_011987	CCATT	2	10	144003	144012	20 %	40 %	0 %	40 %	222102102
2517	NC_011987	CGT	2	6	144084	144089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102102
2518	NC_011987	TCA	2	6	144158	144163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102102
2519	NC_011987	GGCC	2	8	144194	144201	0 %	0 %	50 %	50 %	222102102
2520	NC_011987	CAT	2	6	144536	144541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102103
2521	NC_011987	CTT	2	6	144672	144677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102103
2522	NC_011987	ACG	2	6	144685	144690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102103
2523	NC_011987	TGGC	2	8	144757	144764	0 %	25 %	50 %	25 %	222102103
2524	NC_011987	GTT	2	6	144857	144862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102103
2525	NC_011987	ATG	2	6	144914	144919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102103
2526	NC_011987	ATC	2	6	144922	144927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102103
2527	NC_011987	TCCA	2	8	144930	144937	25 %	25 %	0 %	50 %	222102103
2528	NC_011987	ATCC	2	8	145081	145088	25 %	25 %	0 %	50 %	222102103
2529	NC_011987	CCA	2	6	145155	145160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102103
2530	NC_011987	TC	3	6	145185	145190	0 %	50 %	0 %	50 %	222102103
2531	NC_011987	CCA	2	6	145228	145233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102103
2532	NC_011987	CGA	2	6	145300	145305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102103
2533	NC_011987	CTG	2	6	145400	145405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102103
2534	NC_011987	TGC	2	6	145495	145500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102103
2535	NC_011987	CGG	2	6	145578	145583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102103
2536	NC_011987	TGA	2	6	145584	145589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102103
2537	NC_011987	GC	3	6	145611	145616	0 %	0 %	50 %	50 %	222102103
2538	NC_011987	ATC	2	6	145636	145641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102103
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2540	NC_011987	ATA	2	6	145723	145728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102103
2541	NC_011987	GCA	2	6	145730	145735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102103
2542	NC_011987	TATT	2	8	145803	145810	25 %	75 %	0 %	0 %	222102103
2543	NC_011987	CGT	2	6	145846	145851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102103
2544	NC_011987	CCGC	2	8	145967	145974	0 %	0 %	25 %	75 %	222102103
2545	NC_011987	AGC	2	6	146198	146203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102103
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2547	NC_011987	CGG	2	6	146262	146267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102103
2548	NC_011987	TGGGC	2	10	146270	146279	0 %	20 %	60 %	20 %	222102103
2549	NC_011987	CCA	2	6	146289	146294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102103
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2552	NC_011987	CGC	2	6	146689	146694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102104
2553	NC_011987	CTGC	2	8	146726	146733	0 %	25 %	25 %	50 %	222102104
2554	NC_011987	CTGC	2	8	146759	146766	0 %	25 %	25 %	50 %	222102104
2555	NC_011987	CGC	2	6	146767	146772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102104
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2557	NC_011987	GCT	2	6	146972	146977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102104
2558	NC_011987	TTG	2	6	146988	146993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102104
2559	NC_011987	TGC	3	9	147037	147045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102104
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2561	NC_011987	GGTC	2	8	147159	147166	0 %	25 %	50 %	25 %	222102104
2562	NC_011987	CGAG	2	8	147264	147271	25 %	0 %	50 %	25 %	222102104
2563	NC_011987	TGA	2	6	147342	147347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102104
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2566	NC_011987	CGA	3	9	147493	147501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102105
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2569	NC_011987	TCG	2	6	147585	147590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102105
2570	NC_011987	TCA	2	6	147613	147618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102105
2571	NC_011987	CTG	2	6	147641	147646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102105
2572	NC_011987	TGC	2	6	147663	147668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102105
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2574	NC_011987	CAT	2	6	147908	147913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102105
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2583	NC_011987	CAG	2	6	148309	148314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102106
2584	NC_011987	ACG	2	6	148316	148321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102106
2585	NC_011987	TCA	2	6	148377	148382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102106
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2591	NC_011987	CGGA	2	8	148739	148746	25 %	0 %	50 %	25 %	222102106
2592	NC_011987	CGGCGA	2	12	148758	148769	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222102106
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2607	NC_011987	ATG	2	6	149476	149481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102107
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2621	NC_011987	GGC	2	6	149967	149972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102108
2622	NC_011987	ACC	2	6	150001	150006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102108
2623	NC_011987	CTGCCC	2	12	150173	150184	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	222102108
2624	NC_011987	TTG	2	6	150208	150213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102108
2625	NC_011987	AGA	2	6	150248	150253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102108
2626	NC_011987	AG	3	6	150272	150277	50 %	0 %	50 %	0 %	222102108
2627	NC_011987	TTGA	2	8	150301	150308	25 %	50 %	25 %	0 %	222102108
2628	NC_011987	GAG	2	6	150402	150407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102108
2629	NC_011987	GCC	2	6	150437	150442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102108
2630	NC_011987	TGA	2	6	150443	150448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102108
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2632	NC_011987	CAC	2	6	150471	150476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102108
2633	NC_011987	CGG	2	6	150485	150490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102108
2634	NC_011987	CGA	2	6	150506	150511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102108
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2636	NC_011987	CGA	2	6	150629	150634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102108
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2638	NC_011987	TG	3	6	150859	150864	0 %	50 %	50 %	0 %	222102109
2639	NC_011987	CCG	2	6	150865	150870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102109
2640	NC_011987	CG	3	6	150886	150891	0 %	0 %	50 %	50 %	222102109
2641	NC_011987	GCC	2	6	150906	150911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102109
2642	NC_011987	CGC	2	6	150917	150922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102109
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2644	NC_011987	GCG	3	9	150984	150992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102109
2645	NC_011987	CTGCA	2	10	151001	151010	20 %	20 %	20 %	40 %	222102109
2646	NC_011987	AGGA	2	8	151053	151060	50 %	0 %	50 %	0 %	222102109
2647	NC_011987	TTG	2	6	151062	151067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102109
2648	NC_011987	ATC	2	6	151082	151087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102109
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2650	NC_011987	CGG	2	6	151117	151122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102109
2651	NC_011987	GCA	2	6	151200	151205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102109
2652	NC_011987	CGA	3	9	151210	151218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102109
2653	NC_011987	AAG	2	6	151242	151247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102109
2654	NC_011987	TGA	2	6	151285	151290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102109
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2660	NC_011987	TGT	2	6	151386	151391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102109
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2666	NC_011987	CGAA	2	8	151704	151711	50 %	0 %	25 %	25 %	222102109
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2669	NC_011987	GTG	3	9	151896	151904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102109
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2674	NC_011987	G	6	6	152247	152252	0 %	0 %	100 %	0 %	222102110
2675	NC_011987	CCCG	2	8	152260	152267	0 %	0 %	25 %	75 %	222102110
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2682	NC_011987	TCA	2	6	152504	152509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102110
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2687	NC_011987	CTCC	2	8	152610	152617	0 %	25 %	0 %	75 %	222102110
2688	NC_011987	ACGA	2	8	152686	152693	50 %	0 %	25 %	25 %	222102110
2689	NC_011987	CGAT	3	12	152698	152709	25 %	25 %	25 %	25 %	222102110
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2694	NC_011987	CGGC	2	8	153213	153220	0 %	0 %	50 %	50 %	222102111
2695	NC_011987	GA	3	6	153292	153297	50 %	0 %	50 %	0 %	222102111
2696	NC_011987	CCCG	2	8	153312	153319	0 %	0 %	25 %	75 %	222102111
2697	NC_011987	CGCC	2	8	153346	153353	0 %	0 %	25 %	75 %	222102111
2698	NC_011987	TCG	2	6	153476	153481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102111
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2701	NC_011987	CGA	2	6	153758	153763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102111
2702	NC_011987	CGA	2	6	153785	153790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102111
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2706	NC_011987	CGT	2	6	153979	153984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102112
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2710	NC_011987	TGG	2	6	154155	154160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102112
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2712	NC_011987	GTC	4	12	154207	154218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102112
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2720	NC_011987	ATC	2	6	154879	154884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102113
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2723	NC_011987	CGAA	2	8	154994	155001	50 %	0 %	25 %	25 %	222102113
2724	NC_011987	GCC	2	6	155065	155070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102113
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2728	NC_011987	GCA	2	6	155204	155209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102113
2729	NC_011987	GAT	2	6	155247	155252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102113
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2731	NC_011987	CG	3	6	155338	155343	0 %	0 %	50 %	50 %	222102113
2732	NC_011987	AGC	2	6	155419	155424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102113
2733	NC_011987	CCAT	2	8	155445	155452	25 %	25 %	0 %	50 %	222102113
2734	NC_011987	GGC	2	6	155492	155497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102113
2735	NC_011987	ATC	2	6	155500	155505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102113
2736	NC_011987	TTCCC	2	10	155650	155659	0 %	40 %	0 %	60 %	222102113
2737	NC_011987	CGG	2	6	155710	155715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102113
2738	NC_011987	CGGT	2	8	155779	155786	0 %	25 %	50 %	25 %	222102113
2739	NC_011987	GC	3	6	155875	155880	0 %	0 %	50 %	50 %	222102114
2740	NC_011987	CGA	2	6	155888	155893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102114
2741	NC_011987	GCT	2	6	155957	155962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102114
2742	NC_011987	GTC	2	6	156085	156090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102114
2743	NC_011987	GAA	2	6	156117	156122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102114
2744	NC_011987	TTC	2	6	156171	156176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102114
2745	NC_011987	ATG	2	6	156214	156219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102114
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2747	NC_011987	TCG	2	6	156418	156423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102114
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2751	NC_011987	TCG	2	6	156523	156528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102114
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2753	NC_011987	TCG	2	6	156652	156657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102114
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2763	NC_011987	A	6	6	157351	157356	100 %	0 %	0 %	0 %	222102116
2764	NC_011987	GCC	2	6	157487	157492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102116
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2767	NC_011987	GCCAT	2	10	157722	157731	20 %	20 %	20 %	40 %	222102116
2768	NC_011987	TGC	2	6	157815	157820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102116
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2772	NC_011987	CG	3	6	157979	157984	0 %	0 %	50 %	50 %	222102116
2773	NC_011987	AGC	2	6	157994	157999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102116
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2775	NC_011987	CCGA	2	8	158086	158093	25 %	0 %	25 %	50 %	222102116
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2800	NC_011987	CCAG	2	8	159828	159835	25 %	0 %	25 %	50 %	222102118
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2850	NC_011987	TTC	2	6	162824	162829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102119
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2853	NC_011987	GA	3	6	162969	162974	50 %	0 %	50 %	0 %	222102120
2854	NC_011987	GC	3	6	163096	163101	0 %	0 %	50 %	50 %	222102120
2855	NC_011987	GAA	2	6	163114	163119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102120
2856	NC_011987	CTCA	2	8	163126	163133	25 %	25 %	0 %	50 %	222102120
2857	NC_011987	CG	3	6	163254	163259	0 %	0 %	50 %	50 %	222102120
2858	NC_011987	CTC	2	6	163288	163293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102120
2859	NC_011987	TCA	2	6	163350	163355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102120
2860	NC_011987	TCCAA	2	10	163410	163419	40 %	20 %	0 %	40 %	222102120
2861	NC_011987	TCA	2	6	163478	163483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102120
2862	NC_011987	CAT	2	6	163648	163653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102120
2863	NC_011987	GATTG	2	10	163663	163672	20 %	40 %	40 %	0 %	222102120
2864	NC_011987	GGC	2	6	163729	163734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102120
2865	NC_011987	TTC	2	6	164020	164025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102121
2866	NC_011987	AACAG	2	10	164066	164075	60 %	0 %	20 %	20 %	222102121
2867	NC_011987	TGC	2	6	164177	164182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102121
2868	NC_011987	CATC	2	8	164203	164210	25 %	25 %	0 %	50 %	222102121
2869	NC_011987	CGC	2	6	164217	164222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102121
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2873	NC_011987	CAT	2	6	164355	164360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102121
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2952	NC_011987	TCG	2	6	169244	169249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102125
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2983	NC_011987	GA	4	8	171004	171011	50 %	0 %	50 %	0 %	222102126
2984	NC_011987	TGC	2	6	171052	171057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102126
2985	NC_011987	CAG	2	6	171063	171068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102126
2986	NC_011987	GAT	2	6	171271	171276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102127
2987	NC_011987	GA	3	6	171304	171309	50 %	0 %	50 %	0 %	222102127
2988	NC_011987	GC	3	6	171353	171358	0 %	0 %	50 %	50 %	222102127
2989	NC_011987	GTC	2	6	171374	171379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102127
2990	NC_011987	CGA	2	6	171420	171425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102127
2991	NC_011987	ATC	2	6	171465	171470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102127
2992	NC_011987	AGG	2	6	171471	171476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102127
2993	NC_011987	GGC	2	6	171576	171581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102127
2994	NC_011987	TGC	2	6	171621	171626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102127
2995	NC_011987	GC	3	6	171680	171685	0 %	0 %	50 %	50 %	222102127
2996	NC_011987	CGC	2	6	171742	171747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102127
2997	NC_011987	AGCG	2	8	171796	171803	25 %	0 %	50 %	25 %	222102127
2998	NC_011987	TTG	2	6	171807	171812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102127
2999	NC_011987	CCG	2	6	171837	171842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102127
3000	NC_011987	TCG	2	6	171850	171855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102127

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